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College of Biological Science and Engineering

洪晓昆

发布日期:2024-09-09 发布者:

姓名:洪晓昆

性别:

职称:副研究员(校聘)/硕士生导师

学历:博士研究生

电子邮件:hongxk@fzu.edu.cn

研究方向:生物信息学

研究生招生专业生物工程(学硕)、生物技术与工程(专硕)

教育工作经历:

20238-至今:福州大学 | 完美体育(中国)wm365官方网站

20189-20236月:上海交通大学 |系统生物医学研究院 | 生物学 | 博士

20158-20186月:中山大学 | 生命科学学院 | 动物学 | 硕士

20119-20156月:福州大学 | 完美体育(中国)wm365官方网站 | 生物工程 | 本科

教学简介:

科研简介:

主要研究领域为蛋白质翻译后修饰的系统生物学研究,包括:1. 蛋白质翻译后修饰数据库;2. 蛋白质翻译后修饰调控蛋白功能的计算解析;3.蛋白质翻译后修饰的人工智能预测方法。目前已在Bioinformatics、J Chem Inf Model、 Int J Biol Macromol和J Chem Theory Comput等生物学知名期刊发表SCI论文14篇(中科院1区3篇、中科院2区5篇),其中以第1作者发表论文6篇。授权2项发明专利和2项计算机软件著作权。兼任福建省生物信息学会会员、上海市生物信息学会会员以及Briefings in Bioinformatics审稿人。

科研项目:

主持福州大学科研启动基金1项、测试基金1项;

参与国自然面上项目2项。

代表性论文:

1. Hong X, Li N, Lv J, Zhang Y, Li J*, Zhang J*, Chen HF*. PTMint database of experimentally verified PTM regulation on protein-protein interaction. Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1):btac823

2. Hong X, Song K, Rahman MU, Wei T, Zhang Y, Da LT*, Chen HF*. Phosphorylation Regulation Mechanism of β2 Integrin for the Binding of Filamin Revealed by Markov State Model. J Chem Inf Model. 2023 Jan 23;63(2):605-618

3. Hong X, Lv J, Li Z, Xiong Y, Zhang J*, Chen HF*. Sequence-based machine learning method for predicting the effects of phosphorylation on protein-protein interactions. Int J Biol Macromol. 2023 Jul 15;243:125233

4. Hong X#, Guo T#, Xu X*, Lin J*. Multiplex metabolic pathway engineering of Monascus pilosus enhances lovastatin production. Appl Microbiol Biotechnol. 2023 Nov;107(21):6541-6552

5. Hong X#, Liu X#, Su B*, Lin J*. Improved Antimicrobial Activity of Bovine Lactoferrin Peptide (LFcinB) Based on Rational Design. Protein J. 2023 Dec;42(6):633-644

6. Hong XK#, Zhang X#, Fusco OA, Lan YG, Lun ZR*, Lai DH*. PCR-based identification of Trypanosoma lewisi and Trypanosoma musculi using maxicircle kinetoplast DNA. Acta Trop. 2017 Jul;171:207-212.


授权专利情况

1. 一种检测路氏锥虫的引物对和试剂盒。

2. 一种检测小鼠锥虫的引物对和试剂盒。


授权软件著作权情况

1. 翻译后修饰调控蛋白互作的数据查询系统【简称:PTMint】。

2. 磷酸化修饰调控蛋白互作的人工智能预测系统【简称:PhosPPI】。

获奖情况:

1. 上海交通大学优秀毕业生

2. 硕士研究生国家奖学金

3. 福州大学本科生优秀毕业设计(论文)